Една от първите образователни програми на Центъра за подводна археология се провежда през 2000 г. По проект към Фондация „Отворено общество“, програма „Практически образователни и изследователски проекти на студентски екипи“, направление „Образование“, ЦПА сформира екип от петима студенти от Нов Български университет, които участват за финансиране за провеждане на „Лятна школа по морска история, етнология и подводна археология“. През лятото на 2000 г. се провежда обучение, което включва вземането на водолазен сертификат, теоретични лекции проведени от най-големите специалисти по стара история и доайените на подводната археология в България. Лектори тогава са проф. Михаил Лазаров, проф. Александър Фол, проф. Иван Карайотов, проф. Калин Порожанов, проф. Хенриета Тодорова, Атанас Орачев, Христина Ангелова. Обучението завършва с участие на археологически разкопки на потънал кораб в акваторията на Китен в периода 2000 г. – 2003 г. в съвместна експедиция между Центъра за подводна археология, Созопол и Института по подводна археология в Тексас, САЩ, представляван от д-р Крум Бъчваров – специалист по корабна археология.
